Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPS9P82933 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPS9P82933 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms