Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms