Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER3P43115 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER3P43115 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms