Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP5F1P24539 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms