Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKACGP22612 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms