Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD44P16070 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD44P16070 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD44P16070 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD44P16070 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD44P16070 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CD44P16070 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD44P16070 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CD44P16070 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD44P16070 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD44P16070 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD44P16070 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD44P16070 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD44P16070 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD44P16070 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CD44P16070 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD44P16070 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD44P16070 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD44P16070 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD44P16070 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD44P16070 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD44P16070 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD44P16070 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD44P16070 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD44P16070 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD44P16070 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD44P16070 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD44P16070 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD44P16070 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD44P16070 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CD44P16070 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CD44P16070 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD44P16070 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD44P16070 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD44P16070 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD44P16070 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD44P16070 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD44P16070 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms