Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MGPP08493 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MGPP08493 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MGPP08493 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MGPP08493 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MGPP08493 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MGPP08493 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MGPP08493 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MGPP08493 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MGPP08493 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MGPP08493 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MGPP08493 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MGPP08493 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MGPP08493 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MGPP08493 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MGPP08493 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MGPP08493 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MGPP08493 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms