Protein–RNA interactions for Protein: P06731

CEACAM5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM5P06731 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM5P06731 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM5P06731 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms