Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CITO14578 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CITO14578 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CITO14578 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CITO14578 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CITO14578 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CITO14578 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CITO14578 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CITO14578 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CITO14578 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CITO14578 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CITO14578 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CITO14578 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CITO14578 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CITO14578 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CITO14578 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CITO14578 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CITO14578 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CITO14578 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CITO14578 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CITO14578 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CITO14578 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CITO14578 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CITO14578 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CITO14578 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CITO14578 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CITO14578 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CITO14578 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CITO14578 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CITO14578 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CITO14578 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CITO14578 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CITO14578 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CITO14578 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CITO14578 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CITO14578 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CITO14578 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CITO14578 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CITO14578 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CITO14578 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CITO14578 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CITO14578 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CITO14578 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CITO14578 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms