Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE40O14503 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE40O14503 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms