Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CDO00329 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CDO00329 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CDO00329 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms