Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPIPB6E9PJ23 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms