Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms