Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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