Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CFTRP13569 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFTRP13569 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFTRP13569 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFTRP13569 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFTRP13569 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFTRP13569 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms