Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms