Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NXF3Q9H4D5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms