Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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