Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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