Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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