Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GBX2P52951 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GBX2P52951 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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GBX2P52951 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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GBX2P52951 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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GBX2P52951 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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GBX2P52951 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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GBX2P52951 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GBX2P52951 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GBX2P52951 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GBX2P52951 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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