Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF3P18847 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms