Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF2RAP15509 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms