Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM5BQ9UGL1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms