Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms