Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SLIRPQ9GZT3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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