Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms