Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00269Q8N2A0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms