Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms