Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms