Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms