Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q499Y3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q499Y3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms