Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC1Q13547 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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