Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms