Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRG1Q02297 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms