Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms