Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGCXP38435 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGCXP38435 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGCXP38435 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms