Protein–RNA interactions for Protein: A6NF01

POM121B, Putative nuclear envelope pore membrane protein POM 121B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121BA6NF01 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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POM121BA6NF01 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POM121BA6NF01 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POM121BA6NF01 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POM121BA6NF01 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POM121BA6NF01 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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POM121BA6NF01 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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POM121BA6NF01 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POM121BA6NF01 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POM121BA6NF01 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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POM121BA6NF01 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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POM121BA6NF01 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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POM121BA6NF01 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POM121BA6NF01 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POM121BA6NF01 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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