Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PPARDQ03181 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARDQ03181 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms