Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH16O75309 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH16O75309 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH16O75309 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH16O75309 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH16O75309 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH16O75309 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH16O75309 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms