Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF839A8K0R7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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