Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBA1A5PL33 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms