Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9Y3F1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms