Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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