Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms