Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSNAXIP1Q2TAA8 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms