Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms