Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms