Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL3Q13618 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL3Q13618 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL3Q13618 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL3Q13618 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL3Q13618 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL3Q13618 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL3Q13618 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CUL3Q13618 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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CUL3Q13618 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL3Q13618 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CUL3Q13618 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL3Q13618 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL3Q13618 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CUL3Q13618 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CUL3Q13618 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CUL3Q13618 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CUL3Q13618 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CUL3Q13618 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL3Q13618 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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