Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP4P49662 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASP4P49662 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms